%PDF-1.5 % 4 0 obj << /S /GoTo /D (chapter.1) >> endobj 7 0 obj (Contexte biologique et statistique) endobj 8 0 obj << /S /GoTo /D (section.1.1) >> endobj 11 0 obj (G\350ne d'int\351r\352t : le facteur de transcription) endobj 12 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.1.1.1) >> endobj 15 0 obj (R\364le du g\350ne) endobj 16 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.1.1.2) >> endobj 19 0 obj (Les facteurs de transcription d'Arabidopsis thaliana) endobj 20 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.1.1.3) >> endobj 23 0 obj (Mesure de l'activit\351 des facteurs de transcription) endobj 24 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.1.1.4) >> endobj 27 0 obj (Pertinence de l'utilisation du transcriptome des facteurs de transcription) endobj 28 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.1.1.5) >> endobj 31 0 obj (R\351sultats sur nos donn\351es transcriptomes) endobj 32 0 obj << /S /GoTo /D (section.1.2) >> endobj 35 0 obj (Objectif biologique de la th\350se) endobj 36 0 obj << /S /GoTo /D (section.1.3) >> endobj 39 0 obj (Contexte statistique) endobj 40 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.1.3.1) >> endobj 43 0 obj (Formation d'un r\351seau de facteurs de transcription) endobj 44 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.1.3.2) >> endobj 47 0 obj (Classification double des facteurs de transcription) endobj 48 0 obj << /S /GoTo /D (chapter.2) >> endobj 51 0 obj (Proc\351dures stables de s\351lection de variables) endobj 52 0 obj << /S /GoTo /D (section.2.1) >> endobj 55 0 obj (Gauss-LASSO) endobj 56 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.1.1) >> endobj 59 0 obj (Description) endobj 60 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.1.2) >> endobj 63 0 obj (R\351sultats sur notre jeu de donn\351es) endobj 64 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.1.3) >> endobj 67 0 obj (Evaluation de la stabilit\351 de la proc\351dure) endobj 68 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.1.4) >> endobj 71 0 obj (Stabilisation par r\351\351chantillonnage) endobj 72 0 obj << /S /GoTo /D (section.2.2) >> endobj 75 0 obj (Gauss-LASSO stabilis\351) endobj 76 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.2.1) >> endobj 79 0 obj (Importance des param\350tres) endobj 80 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.2.2) >> endobj 83 0 obj (Comparaison des erreurs de pr\351diction) endobj 84 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.2.3) >> endobj 87 0 obj (Proc\351dures de calibration du seuil bas\351es sur la Log-Vraisemblance) endobj 88 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.2.4) >> endobj 91 0 obj (Evaluation de la stabilit\351 de la proc\351dure) endobj 92 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.2.5) >> endobj 95 0 obj (Extrapolation \340 des jeux de donn\351s de petite taille) endobj 96 0 obj << /S /GoTo /D (section.2.3) >> endobj 99 0 obj (Gauss-LASSO enrichi) endobj 100 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.3.1) >> endobj 103 0 obj (Description) endobj 104 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.3.2) >> endobj 107 0 obj (Vraisemblances calcul\351es sur le jeu entier) endobj 108 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.3.3) >> endobj 111 0 obj (Vraisemblances calcul\351es sur les sous-jeux de s\351lection) endobj 112 0 obj << /S /GoTo /D (section.2.4) >> endobj 115 0 obj (Comparaison des deux proc\351dures) endobj 116 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.4.1) >> endobj 119 0 obj (Supports estim\351s) endobj 120 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.4.2) >> endobj 123 0 obj (Matrices d'adjacence) endobj 124 0 obj << /S /GoTo /D (section.2.5) >> endobj 127 0 obj (Annexes) endobj 128 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.5.1) >> endobj 131 0 obj (Annexe A : Proc\351dure Gauss-LASSO + Choix de p\351nalit\351 par BIC) endobj 132 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.5.2) >> endobj 135 0 obj (Annexe B : Gauss-LASSO stabilis\351) endobj 136 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.5.3) >> endobj 139 0 obj (Annexe C : Calcul des erreurs de pr\351dictions) endobj 140 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.2.5.4) >> endobj 143 0 obj (Annexe D : Gauss-LASSO enrichi) endobj 144 0 obj << /S /GoTo /D (chapter.3) >> endobj 147 0 obj (Classification des graphes orient\351s) endobj 148 0 obj << /S /GoTo /D (section.3.1) >> endobj 151 0 obj (D\351tection de l'h\351t\351rog\351n\351it\351 des graphes) endobj 152 0 obj << /S /GoTo /D (section.3.2) >> endobj 155 0 obj (Mod\350les \340 blocs latents pour des donn\351es binaires) endobj 156 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.3.2.1) >> endobj 159 0 obj (Pr\351sentation du mod\350le) endobj 160 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.3.2.2) >> endobj 163 0 obj (Estimation des param\350tres) endobj 164 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.3.2.3) >> endobj 167 0 obj (Estimation du nombre de classes) endobj 168 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.3.2.4) >> endobj 171 0 obj (R\351sultats) endobj 172 0 obj << /S /GoTo /D (section.3.3) >> endobj 175 0 obj (Indice de comparaison des couples de partitions) endobj 176 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.3.3.1) >> endobj 179 0 obj (Pr\351sentation de l'indice) endobj 180 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.3.3.2) >> endobj 183 0 obj (R\351sultats) endobj 184 0 obj << /S /GoTo /D (section.3.4) >> endobj 187 0 obj (Annexes : algorithmes d'estimation des param\350tres) endobj 188 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.3.4.1) >> endobj 191 0 obj (Annexe A : Algorithme VEM) endobj 192 0 obj << /S /GoTo /D (subsection.3.4.2) >> endobj 195 0 obj (Annexe B : Algorithme V-Bayes) endobj 196 0 obj << /S /GoTo /D (section.3.5) >> endobj 199 0 obj (Annexe C : Comparing high dimensional partitions, with the Coclustering Adjusted Rand Index ) endobj 200 0 obj << /S /GoTo /D (chapter.4) >> endobj 203 0 obj (Proc\351dure de validation du mod\350le global) endobj 204 0 obj << /S /GoTo /D (section.4.1) >> endobj 207 0 obj (Pr\351sentation g\351n\351rale) endobj 208 0 obj << /S /GoTo /D (section.4.2) >> endobj 211 0 obj (R\351sultats) endobj 212 0 obj << /S /GoTo /D (chapter.5) >> endobj 215 0 obj (Conclusion et perspectives) endobj 216 0 obj << /S /GoTo /D (section.5.1) >> endobj 219 0 obj (Conclusion) endobj 220 0 obj << /S /GoTo /D (section.5.2) >> endobj 223 0 obj (Perspectives) endobj 224 0 obj << /S /GoTo /D [225 0 R /Fit] >> endobj 231 0 obj << /Length 62 /Filter /FlateDecode >> stream x3T0 BC]=CceUeg Hl$TT@3D%+ ҁi OX endstream endobj 225 0 obj << /Type /Page /Contents 231 0 R /Resources 230 0 R /MediaBox [0 0 595.276 841.89] /Parent 235 0 R /Group 233 0 R >> endobj 229 0 obj << /Type /XObject /Subtype /Form /FormType 1 /PTEX.FileName (C:/Users/yann/Documents/Orsay/These/Manuscrit/frontpage_yann.pdf) /PTEX.PageNumber 1 /PTEX.InfoDict 236 0 R /BBox [0 0 595.276 841.89] /Group 233 0 R /Resources << /Font << /F18 237 0 R/F37 238 0 R/F16 239 0 R/F38 240 0 R/F39 241 0 R/F40 242 0 R/F41 243 0 R/F42 244 0 R/F36 245 0 R/F43 246 0 R/F44 247 0 R/F17 248 0 R>> /XObject << /Im1 249 0 R /Im2 250 0 R /Im3 251 0 R /Im4 252 0 R /Im5 253 0 R /Im6 254 0 R /Im7 255 0 R >>/ProcSet [ /PDF /Text /ImageC /ImageI ] >> /Length 1518 /Filter /FlateDecode >> stream xڝWIsHWj.57c0ㄌP35̡[2Z(yK A{{k7 0H(J26_.X{`hT"SJƋن{ k# Vw%)iʃU/݇b,Gx䉈Yv8HpF|Kc?[$v K J7 12DpVo?2S q81_b) AJjT8#CwBc<=>ZUhڲL7QCݔmMlчSJĂOuE6$Qu4̺ѻ5oEnF7}O'Wo3$NܲH8Y SHITNZm[l3va~YVm֔ۮ+Unfgsh
֍wuiE;33\%thzbRz^-v*iFa
A·켚G&I(G}nݡVdfz_kH˕ +w5VnoVI0ͷ6|VE9CJgQPWOmF@v
SKt4B})ʄL4-ۅy˂#
iȹUwFfSTaFcƬs_kU7eQE`ok-n!ndX~K2qAGU"{kQv.iQedQQDAˈe^o[>_J2TtN`fPueN 8q@(@u`Ķqb
#2lA'+|o[]Qfs%R\
O$+6&M>
mZi